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如果气相色谱仪自动熄火，可以尝试以下步骤进行排查和处理：
1、检查仪器电源和气路：确认仪器电源是否接通，气路是否畅通，如果电源或气路存在问题，可能导致仪器熄火。
2、检查燃气供应：检查燃气供应是否正常，如氢气发生器或氮气发生器是否在正常工作范围内，如果燃气供应不足或中断，也可能导致仪器熄火。
3、检查仪器内部部件：检查仪器内部的燃气阀门、喷嘴等部件是否正常工作，如果这些部件出现故障，也可能导致仪器熄火，需要专业人员进行检查和维修。
如果以上步骤无法解决问题，建议联系专业的技术人员进行检查和维修。
至于气相色谱仪的关机次序，通常可以按照以下步骤进行：
1、关闭检测器：先关闭检测器电源，如果是FID检测器，需要先将氢气关闭后再关闭空气，如果是ECD等检测器，则需要按照仪器说明书的要求进行操作。
2、关闭工作站和主机：关闭工作站软件，然后关闭主机电源。
3、关闭载气和辅助气体：关闭载气和辅助气体的钢瓶或发生器，如果是使用氢气等燃气，也需要关闭燃气供应系统。
4、清理仪器：清理仪器的外部和内部，确保仪器的清洁和卫生。
具体的关机次序可能会因为不同的仪器型号、配置和使用环境而有所不同，因此最好参考仪器说明书或咨询专业技术人员进行关机操作。